磁粉制動器因過載，或磁粉質量差，扭矩不足，長期燒壞。如果長時間連續燃燒，容易影響剎車的性能和使用壽命。磁粉制動器的內部結構比較精密。如果僅靠自熱冷卻難以實現高效散熱，那就只能加上外部散熱。

　　磁粉制動器可以通過加熱塊冷卻，雖然安裝了軸流風機(鼓風機)，但是如果軸流風機的容量降低，散熱效果變差，那么允許的連續滑轉功率就會降低，所以安裝時請務必在其周圍預留一定的空間。特別是周圍環境惡劣時，軸流風機的防護柵上可能會附著異物，請定期清理。

　　磁粉制動器有水冷和自冷兩種，自冷是靠自身器件的鋁殼罩進行的，水冷是靠水散熱。這兩種散熱方式都是為了降低磁粉制動器的內部和表面溫度。兩種散熱方式沒有絕對的好壞，因為用途不同，選擇也不同，但用戶普遍更喜歡自冷磁粉制動器。